人工培養出來供進一步繁殖用的純菌絲體就是菌種，它相當農作物的種苗。無菌種，人工栽培無法進行；菌種不良；不能獲得優質高產。但菌種必須在無菌的條件下進行分離、接種和培養，因此要有一些基本的設備，除要有實驗室、一配料室和培養室外，還要有

　　（一）接種箱（接種室） 

　　接種室和接種箱是進行菌種分離接種的場所，和外界空間隔絕，防止空氣流動，經過一定的消毒措施后，室內就可達到無菌狀態，防止分離和接種時污染雜菌。一般一個接種箱就可展開工作，如有條件也可建一個接種室。 

　　接種箱是一個木材和玻璃制成的小箱子，箱內有紫外線燈和日光燈，接種箱前后，裝有兩扇能啟閉的玻璃窗，箱前開兩只圓口，圓口裝有布套，一頭釘在圓口上，另一頭用松緊帶縫合成袖套形，雙手可伸入箱內操作。

　　接種箱的特點：結構簡單，造價低廉，消毒徹底，移動方便。但箱內容量小、操作不便，大規模的接種還需接種室。

　　接種室和接種箱一樣，關閉要嚴密，應設在向陽、干燥處，面積6平方米，高2米。地面墻壁要平整、光滑，以利室內滅菌，門窗關閉后要能和外界空氣隔絕。

　　接種室外還有一緩沖間，是工作人員換衣帽及鞋的地方，并可防止外界空氣直接進入接種室。緩沖室用拉門、減少空氣流動，門不要在一條直線上。接種室和緩沖間都要裝紫外線燈及日光燈各一支。接種室內有工作臺及各種用具。

　　（二）分離菌種所需器具  

　　1、酒精燈：火焰滅菌用。

　　2、解剖刀：1～2把，供切割組織塊，剖開種木用。

　　3、接種針：分離菌種時，批取孢子及菌絲。可用自行車鋼條一端磨細彎成3毫米的小鉤制成。

　　4、鑷子：尖嘴小鑷子一把，20厘米長的大鑷子一把，主要用于攝取種菇或其他物品。

　　5、小榔頭：敲打劈開種木時用。

　　6、試管：數量根據實際需要而定，用于培養料面菌種，試管口徑以8一20厘米的較好。

　　7、培養皿：放置食用菌的子實體、采集孢子或注入培養基進行板培養等用。

　　8、漏斗：用于分裝配好的培養基。

　　9、搪瓷盤：用于盛種器皿和用具。

　　10、三角瓶及燒杯：用于制備培養基。

　　11、量筒或量杯：用于計量溶液的體積。

　　12、鋁鍋及電爐：用于加熱溶解瓊脂等培養基原料。

　　13、天平：用于稱量培養基原料。

　　14、棉花：用于制作瓶塞。少量脫脂棉花用于消毒。

　　15、溫度計（干濕球溫度計）：用于測量室內外溫度和濕度。

　　16、試管架、鐵絲試管籠：用于排放試管及裝盛試管培養基進行滅菌消毒等。

　　17、培養容器：用于培養原種及栽培種。如玻璃瓶、塑料袋、塑料瓶。

　　18、培養基滅菌設備：用于培養基的高溫滅菌，常用高壓鍋，也可自制土蒸鍋。

　　19、電熱烘箱：用于干燥法測定含水量，以及玻璃器具的干熱消毒滅菌。

　　20、恒溫培養箱：用于恒溫培養菌種。

　　21、冰箱：在高溫季節，用于保存某些菌種。

　　22、生物顯微鏡：用于觀察、鑒定菌絲及孢子的形態、構造。

　　（三）其他儀器及用具

　　1、孢子收集器：孢子收集器是用來采收菌類孢子的裝置。

　　2、噴霧器：用于給子實體噴霧。

　　3、搖床：搞液體菌種制備，需要搖床。

　　4、注射器、鋁絲筐、紗布。